Die männliche Harnröhre ist ungefähr 20 cm lang. Außerdem haben Männer eine Prostata (Vorsteherdrüse), die unter anderem zur Stabilität des Harnapparates beiträgt. Die Prostata kann sich allerdings bei Männern im fortgeschrittenen Lebensalter vergrößern und somit die Harnröhre einengen.
Die Harnröhre der Frau ist mit 4 Zentimetern erheblich kürzer als die der Männer. Der knappe Abstand zwischen Harnröhre und After kann eher dazu beitragen, dass Darmkeime (z. B. die körpereigenen E.coli-Bakterien) in die Harnwege aufsteigen und sich dort vermehren.
Es ist daher wichtig, den Intimbereich nach dem Stuhlgang immer von vorn nach hinten zu reinigen.